-刚成为Meister却学分不足的艾莉卡·尤奈尼亚，今天也在卡鲁德罗贝接受补习。和平的生活突然因为一颗巨型陨石的来袭而被打破了。在这史无前例的危机前，各个国家第一次携手合作，由Meister·乙HiME进行陨石迎击作战！但是，这只是新的故事的序章，行星艾亚鲁史上最大危机的开幕！！